Оценка генетических маркеров, ассоциированных с развитием бронхолёгочной дисплазии, у недоношенных детей, в структуре прогностической модели её развития
Введение. Бронхолёгочная дисплазия (БЛД) — это комплексное заболевание, в котором важную роль играет генетический фактор. Определение генетических маркеров в совокупности с клиническими и лабораторными данными поможет создать эффективную предикторную модель для прогнозирования вероятности формирования БЛД. Данная информация имеет важное значение в том числе при планировании восстановительного лечения детям младшего возраста.
Цель работы заключалась в определении генетических маркеров, ассоциированных с формированием БЛД у недоношенных детей в структуре создания прогностической модели.
Материалы и методы. На первом этапе для оценки генетических вариантов проведено массовое параллельное секвенирование полного экзома 100 пациентов с последующим биоинформатическим анализом. Далее проведено сравнение полученных результатов между группами пациентов с БЛД и данными секвенирования экзомов детей, не страдающих заболеваниями лёгких. На втором этапе полученные результаты были валидированы с использованием метода ПЦР в режиме реального времени, а также было проведено генотипирование контрольной группы недоношенных детей, не сформировавших БЛД (n = 70). Полученные частоты нуклеотидных вариантов были сопоставлены между группами, а также с общепопуляционными данными и базой данных RUSeq.
Результаты. При сравнении группы пациентов, сформировавших БЛД, с контрольной выборкой установлено, что генетический вариант rs12489516 в гене CPA3 достоверно чаще встречался в контрольной группе недоношенных детей (p = 0,03; ОШ = 0,2; 95% ДИ 0,02–0,94). Наличие его в генотипе уменьшает вероятность развития БЛД в 4,76 раза. Кроме того, при сравнении групп были выявлены статистически значимые различия в относительных частотах нуклеотидного варианта rs45488997 в гене CCN2 (p = 0,023). Данный генетический вариант был специфичен только для детей с БЛД. Установлено также, что нуклеотидный вариант rs45488997 в гене CCN2 встречался статистически чаще среди пациентов с БЛД по сравнению с общей популяцией (p = 0,005). Кроме того, такие генетические варианты, как rs5744174 (TLR5) и rs2476601 (PTPN22), статистически значимо реже наблюдались у пациентов исследуемой группы по сравнению с общепопуляционными показателями (p = 0,03 и p = 0,003 соответственно).
Ограничения исследования. Широкая вариабельность гестационного возраста от 20 до 32 нед в исследуемой группе потенциально могла повлиять на степень экспрессии генов.
Басаргина М.А., Фисенко А.П., Пушков А.А., Жанин И.С., Бондарь В.А., Савостьянов К.В., Давыдова И.В. Оценка генетических маркеров, ассоциированных с развитием бронхолёгочной дисплазии, у недоношенных детей, в структуре прогностической модели её развития. Неврологический журнал имени Л.О. Бадаляна. 2024;5(1):6-13.
08.05.2024